Det er ikke et let spørgsmål at besvare.
I MGS3, en ung Big Boss, før han tildelt titlen, bliver sendt på en mission for at redde en sovjetisk Scientist under Kold krig. Missionen går sure, når The Boss, hans mentor og den bedste soldat i den amerikanske hær, defekter til Sovjetunionen og giver en slyngelstat sovjetisk oberst et par miniature atomvåben.
Obersten kidnapper videnskabsmanden, så han kan bygge en tank kaldet Shagohod, en tidlig form for Metal Gear. Obersten, Volgin, bruger derefter en af atomvåben til at ødelægge den videnskabsmand forskning lab som de undslippe. Fordi nuke er amerikanske lavet, og fordi The Boss var involveret, Sovjetunionen holder os ansvarlige. For at undgå en total krig, USA tilbyder at myrde både The Boss og Volgin, samtidig arbejder på at generobre den videnskabsmand.
Under kodenavnet Naked Snake, den snart-til-være Big Boss er sendt i at fuldføre missionen, under trusler om død.
Efter mødet en række tegn og dræber størstedelen af The Boss 'team, Snake opdager, at Volgin er i besiddelse af de Vises Legacy, en massiv lager af penge lagres af Filosoffer, en gruppe af embedsmænd fra USA, Sovjetunionen og Kina under Anden Verdenskrig.
Både USA og Amerika ønsker det, og gennem hjælp fra en russisk spion ved navn EVA, Snake opdager at en mikrofilm af sine whereabouts eksisterer. Dette betyder ikke noget for meget at Snake, der er mission er at forhindre en atomkrig og dræbe sin mentor /mor-figur.
Han formår at dræbe både Volgin og Shagohod, slutter truslen om atomkrig. , Har dog han til ansigt mod chefen for at fuldføre sin mission, da hun lærte ham, at missionen var vigtigere end noget andet.
Boss bruger den sidste atombombe at ødelægge Volgin base, og de to firkantede off i et felt af hvide blomster. Hun fortæller Snake, at kun en af dem vil overleve og at vinderen vil gå et til at leve et liv i kampene. Hun deler også sin drøm om en verden, der ikke er afhængige af ideologi eller politik, og som kan leve i fred.
Snake dræber hende og undslipper med EVA.
Efter at have tilbragt en nat sammen EVA efterlader Snake en optagelse, der forklarer, at hans mission var en farce. The Boss ikke rigtig defekt, hun kun skulle infiltrere Volgin base for at finde Legacy for Amerika. Volgin brug af nuke var ikke forventet, og så USA måtte hastigt løse det ved at dræbe The Boss. EVA var virkelig en kinesisk spion og har gjort væk med mikrofilm, der afslører arven placering.
Snake er tildelt titlen Big Boss for sine handlinger og bliver desillusionerede med kurset hans liv har taget.
en ung Revolver Ocelot, der var en amerikansk spion alle sammen, afslører, at kineserne rent faktisk har en falsk kopi af mikrofilm, og at USA har allerede halvdelen af det. Han afslører også, at han har de planer om at Metal Gear og har erhvervet dem for den amerikanske regering på foranledning af direktøren for CIA.
MGS4 begynder ganske få år efter MGS2.
Snake har alderen hurtigt af ukendte årsager. Han er kontaktet af oberst Campbell og bedt om at myrde Væske, der er blevet ejer af flere af de største private militære virksomheder i verden. I rummet mellem MGS2 og 4, er krig blevet en vigtig facet af den globale økonomi, og lejesoldater kæmper krige overalt.
For at holde krige og soldater i skak, har et system for overvågning er indledt, kaldet Sons of the Patriots. Det holder en soldat fra følelse følelser og forhindrer også deres våben bliver brugt af andre end ejerne. På den måde er krige lavet til rene virksomheder.
Imidlertid gylle arbejder på en måde at tage kontrol over systemet. Det giver bagslag i Mellemøsten og dybest set forårsager en af hans PMC hære til at miste fuld kontrol, og Snake finder, at han er påvirket også.
Snake og Otacon rejse til Sydamerika for at redde Naomi Hunter, der arbejder med Væske. Der fortæller hun Snake, at han har en muteret form for Foxdie og at mens hans aldrende blot giver ham et par måneder mere at leve, det muterede virus vil være i stand til at inficere alle på planeten i halve tid, så længe han er live.
Flydende atter forsøger at undergrave systemet, men har marginalt bedre resultater. Snake redder Naomi, og hun afslører, at Liquid har kapacitet til at lukke Patriots, at lade ham overtage verden. Naomi og Sunny, Olga datter, begynde at arbejde på en computer virus til at stoppe dette sker.
Snake kommer i kontakt med en modstand foran i påsken Europa for at opfylde deres leder, der har Big Boss 'rester. Lederen viser sig at være en ældre EVA, kvinden, der var Snakes surrogat mor, et medlem af de oprindelige Patriots, og Big Boss 'elsker, men kortvarigt.
Hun forklarer, i en af de længste cutscenes af hele tiden, oprindelsen af patrioter og hvorfor Big Boss forrådt sit land. Major Zero, Big Boss 'kommandør i MGS3, blev også desillusioneret på The Boss' død. Han besluttede at erhverve Vises Legacy med Ocelot hjælp, har Big Boss ødelægge USA tidlige Metal Gear dermed gøre ham til en helt igen, og skabe Patriots at forandre verden til det, Boss altid havde ønsket.
originale Patriots bestod af Zero, Big Boss, EVA, og hele hjælpepersonale fra MGS3. Big Boss og Zero fortolket The Boss "vil forskelligt, og blev fjender på grund af det. Big Boss forlod Patriots og forrådt sit land for at stoppe dem.
EVA afslører resterne af Big Boss, som er dybest set en sæk gelé på livet støtte, og basen er angrebet af PMCs. Efter en chase sekvens, er EVA sårede og Liquid forsøger at brænde Big Boss 'krop, dræbte EVA i processen.
Liquid aktiverer sine Guns of the Patriots, således at deaktivere alle militære på Jorden.
Naomi vender tilbage til Liquid sag. Snake og Ocelot bestemme, at Liquid vil stjæle Metal Gear REX ræling pistol til at lancere en atombombe på satellit, der huser Patriots 'AIs. Snake rejser tilbage til Shadow Moses at stoppe dem.
De ankommer for sent dog, og Liquid gør ud med skinnen pistol. Og Naomi dør. USS Missouri, den eneste fungerende skib i den amerikanske flåde, spor ham og hans flydende fæstning "Outer Haven".
Snake, Meryl, og Johnny infiltrere Ydre Haven, men er delt op. Snake har at kæmpe sig vej forbi delinger af Liquid personlige soldater og snubler gennem en hall af mikrobølge udledere, laver umådelige skade på sig selv i processen. De aktiverer virussen for at forhindre Væske fra at tage kontrol over Patriots indefra.
En optagelse af Naomi afslører, at virus, opkaldt FOXALIVE forhindrer Væske fra at få kontrol, men stadig lukker Patriots og helt ødelægger alt der holder civilisation funktion.
på det højeste punkt i Outer Haven, Liquid afslører, at dette havde været hans plan hele tiden, og at han ønskede at befri verden fra Patriot kontrol. Revolver Ocelot havde tilladt Væske til at tage kontrol med henblik på at slå Patriots. Han og Snake derefter kamp og Snake dræber ham.
Det afslørede, at Sunny havde omskrevet virussen at bevare de dele af Patriots, der holder samfundet sammen, mens du redigerer de kontrollerende aspekter.
Maryl gifter Johnny, Otacon kan begynde at leve et normalt liv og Snake tilsyneladende begår selvmord foran Big Boss 'grav.
Men Snake er ude af stand til at dræbe sig selv. Big Boss dukker op, i live og godt. Han afslører de skjulte punkter bag plottet som Revolver Ocelot bruger nanomaskiner og hypnoterapi til at vedtage Liquid persona. Han afslører, at liget, som Liquid brændte virkelig var den af Solidus Snake. EVA, Ocelot, og han arbejdede sammen for at stoppe Patriots hele tiden. Big Boss afslører, hvorfor han forlod Patriots og han og en nær-katatonisk Major Zero er de sidste tilbage.
Han dræber Major Zero og fortæller Snake at Foxdie i hans krop ikke bliver aktiv, og at han sin frie til at leve resten af sit liv som han vælger. Big Boss sidder på The Boss 'grav, ryge en sidste cigar. Han hilser Snake som en far for første og sidste gang. Han dør der.
Senere Otacon fortæller Snake, at han og Sunny slutter ham i Snake sidste par måneder i live, og at de vil fortsætte hans arv. Snake afsluttes rygning.
