Spillet starter med Murphy Pendleton, fange RS 273A på Ryall State Rettelser Facility, gå ned i en elevator. En vagt, George Sewell, møder dig, når du forlader elevatoren, der fortæller, at det hele er indstillet, og at gøre det hurtigt. Følg vagt. Denne tidlige del af spillet er en slags tutorial for at lade dig vænne sig til kontrollerne. Se tips på skærmen fortæller dig, hvordan du flytter, styre kameraet, eller zoom ind. Det bør også fortælle dig, hvordan at interagere med døre og andre objekter i miljøet.
Vagten fører dig til bruseområdet, der fortæller, at en person "er alle jeres", og at han forlod dig en lille gave på bænken. Åbn døren og gå i. Du hører en stemme fortæller dig, at han vil lade dig ind på en lille hemmelighed. Når du fyre kører brusere, dampen fogs op kameraerne så slemt, at de ikke kan se noget, der går ned i der. Det er et vink til at tænde brusere. Stå ved siden af vandhaner og slå alle brusere på.
Saml et våben fra bænken i hjørnet. Patrick Napier kommer ud af bruser. Han spørger, hvad fanden der foregår, og hvor Sewell er. Han fortæller dig, at der er sket en fejl, han er en afsondret fange og at du ikke skal være der. Du spørger ham, om han genkender dig. Det gør han ikke. Han opfordrer til vagterne, men noone svar.
Du fortæller ham, at du plejede at være naboer. Patrick kører til døren, men dens låst. Han bangs døren, gentagne gange at bede om hjælp. Han fortæller dig det er en krænkelse af hans rettigheder. Den cutscene slutter.
Du er nu meningen at slå ham op. I tilfælde af du ikke vidste, dette er et temmelig grafisk spil. Så hvis du er svag på hjerte, kan dette ikke være spillet for dig. Ellers, hvis du kan stå ser nogle blod og lemlæstelse og andre grafiske scener, fortsæt til at angribe ham.
Din våben vil bryde med tiden, afhente en anden våben og holde slå ham op. Du holder kniven i skulderen. En anden cutscene starter sidst. Han spørger dig hvorfor du gør dette. Du fortæller ham, at han ved præcis hvorfor. Du vågner op fra en drøm inde i din fængselscelle. Sewell håndjern dig. Tilsyneladende du er forfaldne til en overførsel. Han kalder at åbne 302B. Din celle døren åbnes. Følg Sewell gennem gangene, når cutscene slutter. Når du krydser Blok B, en anden cutscene begynder.
Sewell spørger, om du vil savne dem, du fortæller ham ikke engang en lille smule. Han fortæller dig at give det et par dage på Wayside Max og du vil savne dette sted. Du følger fanger til en transport bus. Den kvindelige officer ser ud til at kende dig, med henvisning til du køber navn, som du går ombord i bussen.
I bussen, du falder i søvn, og en anden cutscene begynder. Du ser nogle scener, herunder din søn Charlie leger i haven, forsvinder, og din anholdelse. Når du vågner, en fange ved siden af dig spørger, om du virkelig gjorde det. De kvindelige betjente fortæller ham at holde kæft. Buschaufføren ser tilbage for at se, hvad postyret handler om, og mister kontrollen over bussen, som så ruller ved hovedvejen og ned højderyggen, rullende over et par gange i processen.