Tag en afstikker op til Fars værelse og adgang til den nærliggende terminal for at tilsidesætte lockdown. Når du har endelig gjort det inde i Advanced Systems lab, kør mod reaktorkammeret. Nå reaktoren og aktivere den. Proctor Ingram vil teleportere dig tilbage til relæet rum, hvorefter du bliver nødt til at tale med Maxson og redde Synth version af Shaun. Træde ind relæet igen. Aktiver detonator til at slutte Instituttet, og derefter tale med Maxson at fuldføre questen.